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活動(dòng):表達(dá)譜挖掘云平臺(tái)GENEVESTIGATOR®免費(fèi)試用

[db:作者] - 2020-08-18

目前,全球累積確診感染新型冠狀病毒的人數(shù)突破一百六十萬(wàn),各地的科學(xué)家和研究人員都在緊鑼密鼓地開(kāi)展相關(guān)研究,期望能找出盡快結(jié)束這場(chǎng)戰(zhàn)役的方法。作為致力于基因組學(xué)分析的一員,上海康昱盛也希望能在自己的領(lǐng)域盡一份綿薄之力。

在上月,康昱盛聯(lián)合凱杰公司開(kāi)展了IPA & CLC軟件的免費(fèi)試用活動(dòng),其中IPA能夠助力揭示新冠感染機(jī)制和潛在靶點(diǎn),CLC能夠助力分析新冠基因序列和進(jìn)化路線。而現(xiàn)在,康昱盛聯(lián)合NEBION公司,為正在新冠研究一線奮斗的科研人員提供了另一款強(qiáng)大的分析軟件的免費(fèi)試用:

轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜挖掘比對(duì)平臺(tái)GENEVESTIGATOR®免費(fèi)試用一個(gè)月!
沒(méi)有新冠轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)?沒(méi)有分析方向?GENEVESTIGATOR®為您輕松解決!


GENEVESTIGATOR®是基因表達(dá)的高性能搜索引擎。它集成了上萬(wàn)由專家人工統(tǒng)一精選、注釋與歸一化的公共基因芯片和二代測(cè)序的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,包含了各大開(kāi)源或私人的數(shù)據(jù)庫(kù)中的表達(dá)譜,全部樣本數(shù)目超過(guò)32萬(wàn),人類樣本數(shù)目超過(guò)23萬(wàn),用于人類的基因芯片或測(cè)序平臺(tái)多達(dá)26種,所涉及的疾病超過(guò)500種。GENEVESTIGATOR®將基因在不同的生物環(huán)境,包括疾病、藥物、組織部位、腫瘤、細(xì)胞系或基因型之中的表達(dá)進(jìn)行了可視化,以探索不同生物環(huán)境下不同基因的表達(dá)情況以及基因與生物環(huán)境的潛在深層聯(lián)系。

 
導(dǎo)向1:從基因出發(fā),探索新冠相關(guān)基因在不同情況下的表達(dá)

在前期的新冠研究中,科學(xué)家已經(jīng)發(fā)掘出一系列新冠相關(guān)基因。而GENEVESTIGATOR®可以探索這些特定基因在不同生物環(huán)境下的表達(dá)情況,包括不同組織、細(xì)胞系、癌癥、疾病、藥物和發(fā)育期。研究人員可以自由探索新冠相關(guān)基因(如新冠重要受體ACE2)在不同組織中的表達(dá)情況,判斷病毒影響較大的人體組織器官,推斷新冠影響人體的路徑;可以探索新冠相關(guān)基因在不同性別或年齡層的表達(dá)情況,研究病毒針對(duì)男女或老年人年輕人的不同影響;甚至可以探索新冠相關(guān)基因在不同藥物或化合物中的表達(dá)情況,挖掘潛在治療新冠病毒感染的藥物。以上這些探索不需要研究人員提供數(shù)據(jù),GENEVESTIGATOR®能直接提供分析靈感和文獻(xiàn)支持。



導(dǎo)向2:從生物環(huán)境出發(fā),探索新冠可能影響的特定基因

新冠屬于β型冠狀病毒,和SARS-CoV的基因序列具有很高的相似性,并且共享相同的細(xì)胞表面受體ACE2。GENEVESTIGATOR®可以找出在特定生物環(huán)境下,包括不同組織、細(xì)胞系、癌癥、疾病、藥物和發(fā)育期,高表達(dá)或低表達(dá)的基因。例如,可以計(jì)算挑出在SARS-CoV影響下特異性高表達(dá)或低表達(dá)的基因,這些基因很有可能同樣在新冠影響下特異性表達(dá),甚至可以成為疾病marker或者治療新冠的靶點(diǎn)候選。



導(dǎo)向3:結(jié)合基因與生物環(huán)境,探索新冠相關(guān)基因之間的潛在聯(lián)系

同時(shí),GENEVESTIGATOR®還支持相關(guān)性分析,挖掘出更多在不同生物環(huán)境下和目標(biāo)新冠相關(guān)基因具有潛在關(guān)聯(lián)性的基因,還可以對(duì)這些基因進(jìn)行聚類分析和功能富集分析,進(jìn)一步探索它們的內(nèi)部聯(lián)系和生物功能。此外,如果研究人員能夠提供新冠患者轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),GENEVESTIGATOR®還能夠計(jì)算找出在表達(dá)量上具有逆轉(zhuǎn)關(guān)系的用藥情況,即可能對(duì)于新冠具有治療效果的潛在藥物。



活動(dòng)須知

1.  活動(dòng)時(shí)間:即日起至4月30日。
2.  申請(qǐng)條件:
a)科研院校PI或商業(yè)單位發(fā)送關(guān)于軟件的試用申請(qǐng)(請(qǐng)使用單位郵箱,而非通用郵箱如QQ或163郵箱)至[email protected]
b) 關(guān)注康昱盛微信公眾號(hào)并轉(zhuǎn)發(fā)“為新冠研究加油!GENEVESTIGATOR®免費(fèi)試用一個(gè)月!附加免費(fèi)課程!”本條微信至朋友圈,集齊11個(gè)贊,截圖。

收到您的申請(qǐng)后,我們將在一個(gè)工作日聯(lián)系您。

參考文獻(xiàn):
[1] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet, DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8
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